More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3340 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  100 
 
 
622 aa  1270    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  97.11 
 
 
622 aa  1219    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  66.29 
 
 
634 aa  816    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  52.03 
 
 
624 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.93 
 
 
598 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.4 
 
 
595 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.32 
 
 
588 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.28 
 
 
723 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.02 
 
 
738 aa  337  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.61 
 
 
736 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 
626 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.46 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.99 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.5 
 
 
568 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.16 
 
 
631 aa  299  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  37.21 
 
 
603 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.5 
 
 
643 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  32.78 
 
 
647 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 
647 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  33.45 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
597 aa  250  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.76 
 
 
746 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.64 
 
 
757 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.58 
 
 
658 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.71 
 
 
596 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  38.33 
 
 
531 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  37.36 
 
 
522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  37.43 
 
 
784 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  38.97 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  57.56 
 
 
647 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  55.81 
 
 
642 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  45.45 
 
 
502 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  29.12 
 
 
607 aa  179  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  26.58 
 
 
594 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.07 
 
 
798 aa  177  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  40 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  53.25 
 
 
652 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  53.85 
 
 
667 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 
664 aa  170  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.42 
 
 
769 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  31.82 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  33.89 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  51.18 
 
 
312 aa  164  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  50.3 
 
 
304 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  31.89 
 
 
525 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  47.16 
 
 
317 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  27 
 
 
821 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  42.49 
 
 
543 aa  151  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  46.2 
 
 
310 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  49.7 
 
 
306 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  42.79 
 
 
605 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.4 
 
 
822 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  38.07 
 
 
327 aa  143  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  47.06 
 
 
553 aa  137  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  51.09 
 
 
150 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  45.29 
 
 
408 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.19 
 
 
737 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  30.9 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  33.1 
 
 
510 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  33.08 
 
 
425 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  35.42 
 
 
636 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  45.97 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  35.57 
 
 
646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  36.02 
 
 
608 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  28.36 
 
 
522 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
582 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  30.38 
 
 
375 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
580 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
584 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26.77 
 
 
521 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.12 
 
 
878 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.71 
 
 
878 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.2 
 
 
619 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  26.92 
 
 
606 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  26.98 
 
 
527 aa  94  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  27.55 
 
 
605 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  26.55 
 
 
531 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  26.41 
 
 
600 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  24.62 
 
 
521 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
878 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
686 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
680 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
685 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  24.45 
 
 
603 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  24.19 
 
 
479 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.56 
 
 
810 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.57 
 
 
1023 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
827 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
1392 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  26.09 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.45 
 
 
594 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.41 
 
 
735 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 
296 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>