105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0334 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
605 aa  1219    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 
644 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  46.94 
 
 
646 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  38.77 
 
 
686 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  43.75 
 
 
608 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  37.82 
 
 
784 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  33.74 
 
 
531 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  33.77 
 
 
522 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.79 
 
 
598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.72 
 
 
746 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.29 
 
 
595 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.26 
 
 
634 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.05 
 
 
643 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.79 
 
 
622 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.36 
 
 
622 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  37.66 
 
 
502 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.4 
 
 
736 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.19 
 
 
588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  38.1 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.32 
 
 
624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  31.82 
 
 
499 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.36 
 
 
757 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.45 
 
 
631 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
470 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
626 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  42.77 
 
 
518 aa  124  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.02 
 
 
738 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.36 
 
 
568 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.79 
 
 
723 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.07 
 
 
769 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.93 
 
 
568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  29.86 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  25.96 
 
 
606 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  34.98 
 
 
525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  28.01 
 
 
821 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  27.48 
 
 
600 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  28.28 
 
 
603 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  31.83 
 
 
543 aa  107  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.8 
 
 
822 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  30.42 
 
 
515 aa  103  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  28.19 
 
 
581 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  27.21 
 
 
605 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.11 
 
 
629 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  29.3 
 
 
404 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  33.47 
 
 
510 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.24 
 
 
798 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.02 
 
 
648 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 
596 aa  94  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  25.84 
 
 
603 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
647 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 
647 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
597 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 
375 aa  87  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  41 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 
658 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 
652 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
580 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  28.17 
 
 
667 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  24.48 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  24.52 
 
 
619 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  25.17 
 
 
636 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.92 
 
 
737 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  27.17 
 
 
521 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  25.09 
 
 
607 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  25.61 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  27.08 
 
 
522 aa  72  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
594 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  26.65 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 
582 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  30.88 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  26.88 
 
 
479 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
664 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  23.67 
 
 
596 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.4 
 
 
878 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.39 
 
 
521 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.06 
 
 
626 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  24.56 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  27.89 
 
 
527 aa  51.2  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 
632 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
280 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
1421 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.15 
 
 
462 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  24.17 
 
 
525 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
589 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.4 
 
 
810 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
662 aa  47.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 
1056 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
255 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
635 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
635 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
639 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
614 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
611 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
614 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 
1022 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
740 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.57 
 
 
582 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>