More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2414 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
589 aa  1191    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 
587 aa  316  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.28 
 
 
576 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
686 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
593 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
643 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.08 
 
 
641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
686 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
585 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
581 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
776 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
645 aa  150  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
795 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
762 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 
559 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.59 
 
 
536 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
715 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
748 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  29.87 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
878 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
648 aa  114  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.42 
 
 
810 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
879 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.81 
 
 
875 aa  107  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 
3145 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.91 
 
 
1022 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
556 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
790 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 
639 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
827 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
573 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.19 
 
 
1056 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
744 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
792 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
605 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.16 
 
 
988 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
534 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
612 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
637 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
636 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
1056 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.54 
 
 
626 aa  97.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.54 
 
 
614 aa  97.1  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.54 
 
 
614 aa  97.1  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 
614 aa  97.1  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.04 
 
 
818 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.54 
 
 
626 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 
614 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
635 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
614 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
635 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
611 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
789 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.81 
 
 
626 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38 
 
 
784 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
613 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  35.44 
 
 
623 aa  94.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
689 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
559 aa  95.1  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
718 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
714 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
637 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
615 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
681 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
955 aa  92  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
766 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
649 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
649 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
657 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  23.94 
 
 
582 aa  90.5  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.41 
 
 
816 aa  90.5  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 
714 aa  90.5  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
646 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.06 
 
 
620 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
1094 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
542 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
909 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
620 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  37.18 
 
 
535 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 
824 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.06 
 
 
703 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
3172 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
808 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
1737 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
750 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
685 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
833 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
754 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
828 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
374 aa  86.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
847 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
688 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
828 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.92 
 
 
603 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
629 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.76 
 
 
733 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>