More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1169 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 
619 aa  1272    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  26.98 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  26.02 
 
 
518 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  28.07 
 
 
521 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  26.67 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.97 
 
 
736 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  27.71 
 
 
499 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.61 
 
 
822 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.98 
 
 
757 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27 
 
 
769 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  26.92 
 
 
502 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  23.44 
 
 
522 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  23.43 
 
 
531 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  28.24 
 
 
510 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  27.6 
 
 
521 aa  103  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.27 
 
 
634 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  27.83 
 
 
502 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.2 
 
 
622 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40.5 
 
 
945 aa  97.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  22.69 
 
 
821 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.44 
 
 
746 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.97 
 
 
798 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  37.59 
 
 
323 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  23.75 
 
 
784 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.37 
 
 
622 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  42.59 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.99 
 
 
738 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  22.99 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0794  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40 
 
 
724 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  22.79 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.34 
 
 
624 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  25.12 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.75 
 
 
878 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  25.25 
 
 
531 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  24.78 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  40.38 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.08 
 
 
631 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  32.59 
 
 
409 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  24.52 
 
 
605 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.8 
 
 
643 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  25.57 
 
 
606 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.07 
 
 
595 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.75 
 
 
737 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.51 
 
 
878 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0798  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0821  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.321247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  38.83 
 
 
230 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 
239 aa  70.5  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  21.49 
 
 
686 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.07 
 
 
598 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  37.76 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  32.65 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  36.46 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  35.2 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  35.2 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  35.2 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.96 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  25.29 
 
 
508 aa  67  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 
222 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.43 
 
 
234 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 
230 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  27.68 
 
 
238 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  27.68 
 
 
237 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 
226 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 
237 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  32.99 
 
 
239 aa  65.1  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  32.99 
 
 
239 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  24.76 
 
 
603 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  32.99 
 
 
239 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0589  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  64.7  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
230 aa  64.7  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  31.87 
 
 
237 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 
230 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  26.79 
 
 
237 aa  64.3  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 
228 aa  64.3  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.48 
 
 
230 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.24 
 
 
568 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  26.79 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  26.79 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  21.5 
 
 
565 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  26.79 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  35.79 
 
 
729 aa  63.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 
223 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.1 
 
 
588 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 
237 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 
240 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 
234 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  28.97 
 
 
237 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.75 
 
 
244 aa  61.6  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 
504 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  23.59 
 
 
608 aa  61.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 
228 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 
233 aa  60.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 
235 aa  60.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  30.21 
 
 
234 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.47 
 
 
648 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  30.21 
 
 
234 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  30.21 
 
 
234 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>