More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1009 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.99 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  39.47 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  38.86 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  41.03 
 
 		 267 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  43.1 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.74 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  43.53 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  43.53 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  42.67 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  42.67 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  41.38 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  42.24 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  41.81 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  43.1 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  37.5 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  37.12 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 321 aa  175  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  37.12 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.66 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.66 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.66 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.66 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.66 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.26 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.66 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.23 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>