More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4663 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  100 
 
 
232 aa  463  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  57.39 
 
 
321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  56.44 
 
 
231 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 
233 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
233 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 
229 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 
230 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
233 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
233 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  47.56 
 
 
233 aa  228  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
233 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  47.56 
 
 
233 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
233 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
239 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 
236 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
233 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  48.91 
 
 
239 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
232 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
223 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  48.91 
 
 
239 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 
238 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 
241 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.54 
 
 
237 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  52.17 
 
 
229 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
238 aa  225  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
233 aa  224  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 
230 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
235 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
233 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  48.25 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
233 aa  222  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 
247 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
223 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
227 aa  221  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 
223 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  49.36 
 
 
239 aa  221  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
239 aa  221  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
239 aa  221  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.67 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  46.43 
 
 
223 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
223 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  44.69 
 
 
233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  50 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
235 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  46.88 
 
 
223 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  45.98 
 
 
223 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  44 
 
 
234 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  44.44 
 
 
234 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
230 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 
234 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 
237 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 
234 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  48.51 
 
 
235 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 
232 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 
223 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  50 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 
233 aa  214  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
239 aa  214  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  45.22 
 
 
237 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
236 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
239 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
231 aa  214  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.16 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  51.95 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  52.23 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.93 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.16 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  52 
 
 
227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>