More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0644 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.19 
 
 		 228 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.16 
 
 		 223 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  55.31 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  53.81 
 
 		 228 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  53.36 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 224 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  44.59 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  44.59 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  48.5 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  47.27 
 
 		 223 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  46.82 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  46.82 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  49.79 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.23 
 
 		 223 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  44.14 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 223 aa  207  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  44.14 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  48.1 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  48.88 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  46.82 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  48.1 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  46.82 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  47.5 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  47.5 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  47.5 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  47.68 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  47.68 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  47.68 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  47.68 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.75 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  44.68 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>