More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1658 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 230 aa  466  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.97 
 
 		 231 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  60.35 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 230 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  46.58 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.92 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  46.15 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  45.13 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  48.03 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  48.03 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  48.03 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  45.61 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  45.18 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.81 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.59 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>