More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0154 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  59.92 
 
 		 228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.03 
 
 		 228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 227 aa  298  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.47 
 
 		 223 aa  295  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  54.55 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  54.55 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 227 aa  244  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.14 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  51.97 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  51.53 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.52 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  50.65 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  50.65 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  46.64 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  46.64 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  46.64 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 238 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.14 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  50.42 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.5 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.73 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  49.58 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  45.26 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.55 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  45.57 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.92 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.63 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  47.64 
 
 		 256 aa  205  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.44 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  45.96 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.2 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.68 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.49 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.59 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>