More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0200 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  57.59 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.44 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  57.78 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  57.59 
 
 		 228 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  57.78 
 
 		 229 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  59.03 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  58.22 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.22 
 
 		 229 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  56.89 
 
 		 227 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  56.7 
 
 		 225 aa  248  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  56.58 
 
 		 230 aa  248  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.8 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.86 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.04 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  54.59 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 		 226 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 		 226 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 226 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 226 aa  234  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.7 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.65 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  56.7 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  52.21 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.54 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  56.7 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 235 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.98 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  50.89 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 223 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 246 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  46.46 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.26 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  45.54 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.65 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.16 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>