More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 226 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  69.03 
 
 		 226 aa  320  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  69.33 
 
 		 226 aa  317  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.33 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  69.33 
 
 		 230 aa  315  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  67.56 
 
 		 229 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  68 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  68.44 
 
 		 229 aa  312  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.26 
 
 		 226 aa  310  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.83 
 
 		 231 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  68.58 
 
 		 229 aa  309  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 229 aa  308  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.37 
 
 		 226 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.33 
 
 		 226 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.78 
 
 		 226 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.78 
 
 		 226 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  64.32 
 
 		 227 aa  298  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  68.44 
 
 		 226 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  63.32 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.66 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.8 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.6 
 
 		 229 aa  294  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.83 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  63.32 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  64.16 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  62.17 
 
 		 234 aa  288  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.79 
 
 		 231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  67.7 
 
 		 227 aa  278  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  67.7 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.38 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.75 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.61 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  49.78 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  49.33 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  47.32 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  46.88 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  48 
 
 		 256 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.86 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 237 aa  215  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>