More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2106 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  64.22 
 
 		 236 aa  318  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  63.16 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  57.39 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  56.96 
 
 		 231 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  54.89 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  54.89 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 		 232 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  53.19 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  49.11 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  48.5 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  49.78 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 230 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  50.22 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 231 aa  224  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.89 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 		 230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 228 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  49.15 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  49.15 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  50 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  50 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 235 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  47.86 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.98 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  46.02 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.54 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 250 aa  210  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.51 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  44.98 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>