More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0188 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  88.57 
 
 		 245 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  66.23 
 
 		 230 aa  305  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.4 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  64.32 
 
 		 236 aa  299  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 230 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.35 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 229 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.19 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  47.6 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  43.91 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  46.75 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 242 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  45.78 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 243 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  43.17 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.97 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  47.81 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.74 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  43.16 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  45.22 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  47.81 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  43.36 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  46.05 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 226 aa  198  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 248 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  47.14 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  45.61 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.36 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.11 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  45.61 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  41.56 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  41.56 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  41.45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  41.45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  41.45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  41.45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.31 
 
 		 239 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 230 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 237 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>