More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0717 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  97.11 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  60.78 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  60.43 
 
 
254 aa  299  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  60.34 
 
 
245 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.94 
 
 
250 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.94 
 
 
250 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.46 
 
 
250 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
250 aa  259  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  53.16 
 
 
250 aa  255  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0392  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.62 
 
 
253 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.958031  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2902  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  47.21 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  45.22 
 
 
226 aa  208  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 
228 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  46.58 
 
 
256 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
236 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 
236 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.78 
 
 
230 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
230 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 
226 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 
231 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
234 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
226 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 
230 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  45.11 
 
 
234 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 
239 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
230 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 
226 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 
226 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.91 
 
 
229 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 
226 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.91 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 
245 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.17 
 
 
229 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.88 
 
 
242 aa  199  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  44.35 
 
 
229 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
228 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 
237 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 
228 aa  195  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 
226 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
229 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.03 
 
 
246 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.04 
 
 
229 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
226 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 
238 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
233 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
236 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
224 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 
242 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
229 aa  191  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  42.61 
 
 
227 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 
232 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
224 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  44.02 
 
 
237 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
239 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 
235 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
228 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
228 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 
237 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 
237 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 
237 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
228 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
228 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
228 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.17 
 
 
228 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.7 
 
 
237 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.28 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 
235 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
236 aa  187  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 
239 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 
226 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 
238 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 
246 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 
246 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 
237 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 
234 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 
237 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40 
 
 
239 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.13 
 
 
226 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 
230 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 
224 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>