More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2827 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  57.66 
 
 		 224 aa  274  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.91 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1961  phosphate regulon response regulator PhoB  47.11 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  45.98 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2550  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.7 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.7 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.04 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  41.92 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.3 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.2 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.27 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.71 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.92 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.21 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.7 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  41.03 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 245 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40.44 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2257  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512842  normal  0.410356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>