More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1419 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  61.21 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.87 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.31 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  57.58 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.19 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  54.94 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  52.23 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.1 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.07 
 
 		 227 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  51.34 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  51.74 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  50.22 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  49.57 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.3 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  50.87 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  48.74 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  48.94 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  48.72 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  50.85 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.06 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  47.64 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  47.21 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  47.21 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  48.54 
 
 		 250 aa  214  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  48.9 
 
 		 226 aa  214  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  49.13 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.94 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.94 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.4 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>