More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0588 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  68.14 
 
 		 225 aa  317  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  67.4 
 
 		 226 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.58 
 
 		 225 aa  310  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  67.4 
 
 		 225 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.7 
 
 		 225 aa  307  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  68.89 
 
 		 228 aa  307  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.22 
 
 		 225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  64 
 
 		 226 aa  299  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  64 
 
 		 226 aa  299  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  66.37 
 
 		 225 aa  294  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 		 243 aa  236  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.63 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 231 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 236 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 272 aa  221  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  49.34 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  48.67 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  48.25 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2257  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 243 aa  214  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512842  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.92 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.93 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  50.86 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  48.28 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.37 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2550  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  47.79 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.19 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  50.43 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  50.43 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  50.43 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  48.23 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  50.43 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  50.43 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  50.43 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  50.43 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>