More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2387 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.04 
 
 
230 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  77.29 
 
 
229 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  67.11 
 
 
227 aa  309  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  62.01 
 
 
227 aa  295  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 
231 aa  277  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.53 
 
 
230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.71 
 
 
225 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  54.91 
 
 
225 aa  251  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 
226 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 
226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 
225 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2550  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 
225 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 
225 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
226 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 
226 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
243 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 
236 aa  228  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 
230 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 
230 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 
228 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 
230 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
232 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  48.51 
 
 
239 aa  218  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
226 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
234 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  52 
 
 
231 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 
235 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
238 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.81 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  46.81 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  46.81 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.81 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.81 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  46.81 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  46.81 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 
223 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 
223 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  44.93 
 
 
223 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
223 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  46.84 
 
 
239 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  46.84 
 
 
239 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  44.93 
 
 
223 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
223 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 
231 aa  209  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
223 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
236 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 
231 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  46.93 
 
 
235 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
239 aa  208  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
239 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
223 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 
235 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
250 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
250 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  48.48 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  48.48 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
236 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
250 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 
236 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 
233 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  48.48 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
227 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 
232 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 
236 aa  205  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
235 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.81 
 
 
226 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
227 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 
234 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
231 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 
237 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  47.84 
 
 
241 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
230 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
229 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.15 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
241 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>