More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0170 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  50.9 
 
 		 228 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 227 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  46.12 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  44.59 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  44.59 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  46.02 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  44.87 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  44.35 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.54 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  42.08 
 
 		 254 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  42.08 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  42.98 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  42.98 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  42.98 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  44.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  44.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>