More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2286 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 233 aa  314  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.97 
 
 		 230 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 227 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 230 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  49.32 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  48.87 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  221  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 238 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  43.59 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  44.02 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 238 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.52 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.41 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  46.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  46.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  46.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.1 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.67 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>