More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2159 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 		 223 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 		 223 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  54.42 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  54.42 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 242 aa  203  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.43 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.98 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  47.16 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  46.29 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.79 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.47 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.39 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.47 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3617  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  44.69 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.13 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>