More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0243 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 
230 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 
229 aa  272  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 
229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  54.35 
 
 
231 aa  230  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 
234 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  50.21 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 
237 aa  224  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 
229 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  55.46 
 
 
297 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 
231 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 
232 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 
238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
230 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.52 
 
 
235 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  50.88 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  50.88 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.68 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.23 
 
 
235 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  52.84 
 
 
233 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  55.17 
 
 
232 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
232 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 
231 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.63 
 
 
243 aa  215  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 
227 aa  215  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
246 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  53.22 
 
 
246 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
246 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 
232 aa  214  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
230 aa  211  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  49.12 
 
 
239 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.12 
 
 
239 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.12 
 
 
239 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  50.87 
 
 
232 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  49.12 
 
 
239 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  49.12 
 
 
239 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  49.56 
 
 
239 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  49.12 
 
 
239 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  49.56 
 
 
239 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  49.12 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
237 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 
232 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 
236 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
237 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
228 aa  208  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  48.48 
 
 
236 aa  208  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
234 aa  207  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 
237 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  207  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
321 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
238 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
231 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.14 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 
230 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
231 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 
233 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 
227 aa  205  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
234 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 
228 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 
230 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  50.87 
 
 
251 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 
223 aa  204  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 
234 aa  204  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  50 
 
 
265 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  50 
 
 
265 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
234 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  47.6 
 
 
256 aa  204  8e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
240 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.69 
 
 
232 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.69 
 
 
232 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 
237 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
229 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
234 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
232 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  45.69 
 
 
232 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  48.25 
 
 
234 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.91 
 
 
254 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>