More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1110 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
234 aa  485  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
227 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 
229 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 
230 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 
225 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
226 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 
228 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
229 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
225 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 
225 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 
230 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
225 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 
226 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 
225 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 
230 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
226 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
230 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 
231 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
234 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 
226 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
230 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
236 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 
225 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
231 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
230 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 
243 aa  187  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 
236 aa  187  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
225 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.04 
 
 
239 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
235 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
236 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
232 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
230 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 
235 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
236 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
239 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
225 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
239 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 
233 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 
232 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 
236 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.05 
 
 
226 aa  177  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
237 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.23 
 
 
237 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 
236 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2550  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 
228 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  43.23 
 
 
237 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 
231 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
245 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 
229 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 
231 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 
232 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
229 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.54 
 
 
229 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
235 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.19 
 
 
235 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 
228 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 
228 aa  174  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.78 
 
 
236 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.54 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 
236 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  39.19 
 
 
229 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 
237 aa  171  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 
234 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  40.99 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  40.99 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
242 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
230 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 
246 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 
229 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  37.56 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
226 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 
223 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 
247 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>