More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0439 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 
229 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 
230 aa  241  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
228 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 
230 aa  234  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
237 aa  232  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 
233 aa  229  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 
237 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48 
 
 
229 aa  228  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  50.21 
 
 
235 aa  229  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  50 
 
 
235 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  50 
 
 
235 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  49.36 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 
229 aa  224  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
232 aa  224  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
235 aa  223  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 
232 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
229 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
236 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.4 
 
 
226 aa  218  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 
227 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.3 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
236 aa  217  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
235 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
237 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
239 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
230 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
239 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 
234 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
231 aa  215  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.85 
 
 
229 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 
235 aa  214  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  45.65 
 
 
233 aa  214  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  46.85 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  45.37 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
242 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
234 aa  211  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
228 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
226 aa  211  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
238 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  47.58 
 
 
234 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
237 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  45.69 
 
 
237 aa  209  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 
228 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
237 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
231 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 
226 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
229 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 
226 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 
226 aa  208  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 
230 aa  207  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 
237 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 
237 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  47.09 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 
233 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 
237 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
237 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 
230 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 
230 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  47.09 
 
 
230 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.19 
 
 
229 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 
234 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 
236 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 
237 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
229 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
232 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 
230 aa  205  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 
226 aa  205  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
229 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
234 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  44.93 
 
 
234 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
228 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
234 aa  204  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 
235 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 
227 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
230 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 
235 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>