More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0771 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  71.98 
 
 		 226 aa  325  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  71.3 
 
 		 229 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.96 
 
 		 237 aa  320  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  70.43 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.82 
 
 		 235 aa  318  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 228 aa  318  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.17 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  71.74 
 
 		 226 aa  315  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  70 
 
 		 226 aa  314  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  69.53 
 
 		 230 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  70 
 
 		 226 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.4 
 
 		 226 aa  309  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.26 
 
 		 226 aa  309  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  66.96 
 
 		 229 aa  308  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.4 
 
 		 226 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  75.11 
 
 		 231 aa  307  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  66.09 
 
 		 234 aa  307  9e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.7 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.1 
 
 		 231 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  67.38 
 
 		 229 aa  304  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 228 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 228 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 228 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  66.52 
 
 		 227 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  67.39 
 
 		 228 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  67.83 
 
 		 225 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.65 
 
 		 226 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  64.68 
 
 		 228 aa  298  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  66.96 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.54 
 
 		 246 aa  295  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.16 
 
 		 226 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  66.96 
 
 		 227 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.61 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 227 aa  278  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.12 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.6 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.04 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  41.92 
 
 		 237 aa  204  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  45.3 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.11 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  45.41 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.06 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 227 aa  198  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  45.45 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  43.59 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>