More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0436 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  97.96 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  60.43 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  60.78 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  60.78 
 
 		 242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.94 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.94 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 250 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.14 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0392  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.958031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.89 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.67 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  44.92 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.59 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2902  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.72 
 
 		 225 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  44.59 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.68 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 228 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.22 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  45.73 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  44.26 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.42 
 
 		 229 aa  197  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.07 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  44.07 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  43.75 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  43.75 
 
 		 228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.78 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 232 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  41.99 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  37.87 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  42.74 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40.87 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>