More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.11 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.67 
 
 		 223 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.6 
 
 		 226 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.63 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  66.81 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.04 
 
 		 227 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  65.04 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.91 
 
 		 230 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.37 
 
 		 222 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  64.6 
 
 		 222 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.32 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.06 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.15 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.22 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  52.19 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1844  response regulator receiver  56.52 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05980  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  53.42 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.553702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  45.37 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  42.8 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  47.56 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  42.06 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  47.56 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.6 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.39 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  46.26 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  46.26 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.11 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.75 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.17 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.37 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  41.3 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  42.29 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.4 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 250 aa  178  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.2 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>