More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1058 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  87.67 
 
 		 227 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  85.9 
 
 		 227 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.78 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.42 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  51.54 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 231 aa  227  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.66 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 227 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.32 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 242 aa  211  9e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  49.78 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.13 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.44 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  45.09 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.35 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.64 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.39 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 238 aa  201  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.58 
 
 		 239 aa  201  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 263 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 263 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  47.58 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 263 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  46.19 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  46.98 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4069  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  47.53 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>