More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1681 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  50.45 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 222 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  46.26 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  48.71 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  48.28 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  48.28 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.22 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.6 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  41.89 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 235 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 272 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 229 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 		 230 aa  192  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.84 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  46.49 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  47.62 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.05 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.05 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.05 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.8 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  44.84 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>