More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0967 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  99.13 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.59 
 
 		 229 aa  370  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.94 
 
 		 225 aa  361  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  80.7 
 
 		 225 aa  360  9e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.3 
 
 		 261 aa  348  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.91 
 
 		 225 aa  344  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.09 
 
 		 226 aa  341  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  79.74 
 
 		 225 aa  340  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  80.18 
 
 		 225 aa  338  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0770  winged helix family two component transcriptional regulator  80.18 
 
 		 225 aa  336  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.22 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  75.44 
 
 		 224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 224 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  79.3 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.01 
 
 		 225 aa  327  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  76.65 
 
 		 228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  76.21 
 
 		 228 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  72.65 
 
 		 223 aa  323  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2332  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.09 
 
 		 227 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0100882  decreased coverage  0.00000063533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.25 
 
 		 227 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  77.53 
 
 		 225 aa  322  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  75.33 
 
 		 228 aa  322  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.21 
 
 		 228 aa  318  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.49 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.93 
 
 		 225 aa  316  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  75.33 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.33 
 
 		 228 aa  314  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.86 
 
 		 227 aa  309  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  67.11 
 
 		 239 aa  294  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.78 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  53.65 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  50.89 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.56 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  50.67 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  49.56 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  50.22 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  49.11 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  48.67 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.83 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  46.64 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  46.72 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  47.56 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  46.29 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  48 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>