More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2358 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  68.56 
 
 		 236 aa  327  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  68.14 
 
 		 236 aa  321  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  52.23 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  51.34 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  48 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.72 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.46 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  44.3 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  44.3 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  43.04 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  41.96 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  41.96 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.15 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.89 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  41.92 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>