More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04710 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  56.96 
 
 
237 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  57.83 
 
 
237 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  56.52 
 
 
237 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  56.52 
 
 
237 aa  278  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  57.39 
 
 
238 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  55.65 
 
 
237 aa  278  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  56.09 
 
 
237 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  56.09 
 
 
237 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  56.09 
 
 
237 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  47.37 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  46.93 
 
 
234 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
233 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  48.68 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
233 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  48.25 
 
 
233 aa  231  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
233 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
232 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
233 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 
233 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
235 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
228 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  46.58 
 
 
233 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
230 aa  224  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  48.02 
 
 
228 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  47.83 
 
 
229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  48.46 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  48.46 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  48.46 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  48.46 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
228 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 
232 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
237 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 
232 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
225 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 
234 aa  215  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
234 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 
237 aa  215  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
230 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
232 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
225 aa  214  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.65 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  48.23 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.9 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  48.23 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
236 aa  211  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.44 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 
235 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 
228 aa  210  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.01 
 
 
235 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 
230 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.01 
 
 
235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 
235 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
230 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
232 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
228 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
234 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
229 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
231 aa  208  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
232 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 
237 aa  208  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 
230 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  48.26 
 
 
239 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 
235 aa  207  8e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 
234 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
229 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
229 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
233 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
233 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 
229 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
229 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 
230 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 
232 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
232 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
229 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>