More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2940 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.46 
 
 		 228 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 231 aa  336  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  60.87 
 
 		 234 aa  292  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  60.43 
 
 		 234 aa  291  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  59.03 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  58.59 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  58.19 
 
 		 236 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  57.96 
 
 		 233 aa  277  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  57.96 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  58.41 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  57.96 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  57.96 
 
 		 233 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  57.96 
 
 		 233 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  57.52 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  57.52 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  56.83 
 
 		 234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  55.7 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  54.26 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  53.74 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 228 aa  255  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  56.25 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.71 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  50.87 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  50 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  50.43 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  49.13 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 231 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.46 
 
 		 237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 232 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 232 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  45.49 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  45.49 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  45.49 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  45.49 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.54 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  43.11 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  43.11 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>