More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2674 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  100 
 
 
232 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  99.57 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  61.14 
 
 
231 aa  286  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.03 
 
 
228 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 
228 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  60.09 
 
 
234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  57.21 
 
 
246 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  59.23 
 
 
234 aa  267  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 
233 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  57.71 
 
 
233 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  57.89 
 
 
233 aa  266  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  57.89 
 
 
233 aa  266  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  57.89 
 
 
233 aa  266  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  57.46 
 
 
233 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  57.71 
 
 
233 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
233 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 
233 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 
233 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  55.65 
 
 
233 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.03 
 
 
234 aa  258  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 
228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  54.11 
 
 
234 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  55.8 
 
 
228 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  54.55 
 
 
234 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  54.35 
 
 
233 aa  257  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  53.91 
 
 
229 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  55.17 
 
 
234 aa  248  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  51.69 
 
 
236 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  51.95 
 
 
232 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  51.52 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  51.95 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  51.95 
 
 
232 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  50.88 
 
 
231 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 
232 aa  228  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
231 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 
225 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 
232 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
232 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
232 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
232 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 
232 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
232 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  46.32 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.89 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.89 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 
232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
235 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 
230 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
237 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 
237 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
230 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
230 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44.44 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  44 
 
 
230 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
230 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
230 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  44.44 
 
 
230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 
225 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  44 
 
 
230 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  44 
 
 
238 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
229 aa  202  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
232 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
237 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  42.67 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 
237 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  47.79 
 
 
230 aa  199  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.74 
 
 
229 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
228 aa  193  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 
228 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 
230 aa  192  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 
236 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
233 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
236 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>