More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2373 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  97.4 
 
 
231 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  96.97 
 
 
231 aa  461  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  96.97 
 
 
231 aa  460  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  96.54 
 
 
231 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  96.1 
 
 
231 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  96.1 
 
 
231 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  96.1 
 
 
231 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  96.1 
 
 
231 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  96.1 
 
 
231 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  90.95 
 
 
232 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 
234 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  55.46 
 
 
228 aa  262  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 
229 aa  258  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.4 
 
 
234 aa  255  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  56.14 
 
 
230 aa  254  6e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  54.35 
 
 
233 aa  251  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  53.91 
 
 
233 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 
233 aa  248  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  53.48 
 
 
233 aa  248  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 
233 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  53.04 
 
 
233 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  53.04 
 
 
233 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  53.04 
 
 
233 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  54.59 
 
 
230 aa  247  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  53.04 
 
 
233 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 
233 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 
246 aa  241  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  50.66 
 
 
234 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
232 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
232 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
232 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  50 
 
 
233 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  50.22 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  49.78 
 
 
232 aa  238  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  49.78 
 
 
232 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  50 
 
 
233 aa  234  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 
232 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 
235 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
228 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  50 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 
234 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 
228 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 
232 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 
232 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 
234 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 
228 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  50.22 
 
 
228 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  50 
 
 
232 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  50 
 
 
232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  50 
 
 
232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  50 
 
 
232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  50 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 
231 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  49.11 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  49.11 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  46.05 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 
234 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
228 aa  210  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  46.84 
 
 
234 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 
229 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
228 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  46.78 
 
 
236 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 
230 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.29 
 
 
229 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
235 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 
237 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 
236 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 
230 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
230 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
227 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
232 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
230 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
230 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 
230 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  44.16 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  44.78 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  44.16 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
230 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
230 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 
237 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 
225 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
223 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
223 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>