More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1869 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  94.83 
 
 
232 aa  454  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  93.97 
 
 
232 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  93.1 
 
 
232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  92.67 
 
 
232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  93.1 
 
 
232 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  92.67 
 
 
232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  92.67 
 
 
232 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  92.24 
 
 
232 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.54 
 
 
234 aa  262  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 
234 aa  259  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
233 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
233 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  49.78 
 
 
233 aa  250  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  50.22 
 
 
233 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
233 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
233 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
233 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 
233 aa  248  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
233 aa  248  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  49.35 
 
 
233 aa  248  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 
228 aa  248  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 
231 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  47.19 
 
 
234 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.87 
 
 
228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
231 aa  244  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  46.75 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  51.3 
 
 
232 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  51.3 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  51.3 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  51.3 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  50.87 
 
 
232 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
231 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
231 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  51.74 
 
 
232 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  51.3 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  48.05 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  47.19 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 
232 aa  238  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 
232 aa  238  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  51.95 
 
 
232 aa  238  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 
232 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 
232 aa  235  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
246 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 
233 aa  235  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  48.72 
 
 
234 aa  228  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  48.29 
 
 
234 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 
232 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 
235 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 
236 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
228 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  50 
 
 
225 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 
231 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  46.7 
 
 
228 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.72 
 
 
237 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
230 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
230 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
237 aa  215  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
230 aa  214  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
230 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
230 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  47.37 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  47.37 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
230 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 
237 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
230 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
230 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 
233 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 
229 aa  206  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
237 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
228 aa  203  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0041  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 
231 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
232 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
239 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
239 aa  202  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 
237 aa  197  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 
230 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 
225 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
233 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
229 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
230 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 
232 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
234 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>