More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0488 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  90.09 
 
 
232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 
234 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  47.37 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  46.93 
 
 
234 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 
236 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 
228 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  48 
 
 
232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  48 
 
 
232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
233 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  48.25 
 
 
233 aa  234  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
233 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
234 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
233 aa  234  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
233 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  47.81 
 
 
233 aa  234  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
233 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 
231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
234 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
228 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 
231 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
232 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
233 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  48.48 
 
 
228 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
232 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
233 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
231 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
232 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
225 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
237 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
232 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  45.61 
 
 
232 aa  224  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 
234 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  46.12 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  45.85 
 
 
233 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 
232 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  45.61 
 
 
232 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
232 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
232 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1833  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
227 aa  222  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 
232 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 
237 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
231 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
238 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 
237 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  45.78 
 
 
237 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 
232 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 
232 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 
237 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 
229 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 
233 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 
237 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
229 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
232 aa  204  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.135137  hitchhiker  0.000253397 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.48 
 
 
242 aa  202  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.78 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
223 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 
229 aa  198  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  43.61 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  44.3 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.17 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 
223 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
232 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 
223 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>