More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3518 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.19 
 
 		 234 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  58.12 
 
 		 233 aa  277  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  58.55 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  58.12 
 
 		 233 aa  276  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  58.55 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  58.55 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  58.12 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  58.12 
 
 		 233 aa  276  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  58.12 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  58.33 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  57.69 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  58.12 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  57.46 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  56.77 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  57.39 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  55.46 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  56.77 
 
 		 231 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  57.39 
 
 		 231 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  57.39 
 
 		 231 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  57.39 
 
 		 231 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  57.39 
 
 		 231 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  52.81 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  56.65 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  51.95 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  51.52 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  56.65 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.35 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  51.08 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.04 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  56.33 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 		 236 aa  248  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  55.17 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  54.74 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  51.71 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  52.42 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  52.86 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  52.42 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  51.98 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  51.98 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  52.79 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  53.28 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  50.87 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  52.81 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  46.32 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  47.81 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  47.37 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.78 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>