More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2813 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.35 
 
 		 228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.03 
 
 		 228 aa  328  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  61.14 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  60.7 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  56.84 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  56.84 
 
 		 234 aa  274  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  53.16 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  54.11 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  54.11 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  54.11 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  53.25 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  53.68 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  53.68 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  53.68 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  53.25 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  53.25 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  50.43 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  50.43 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.36 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  50.88 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  48.92 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  51.79 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  47.86 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  47.86 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  47.44 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  47.64 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  47.44 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.41 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  41.3 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  41.59 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  45.58 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>