More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1529 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.37 
 
 
228 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  56.14 
 
 
229 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  55.7 
 
 
229 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  55.7 
 
 
233 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  55.7 
 
 
233 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  55.26 
 
 
233 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  55.7 
 
 
229 aa  278  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  55.26 
 
 
229 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  55.26 
 
 
229 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 
230 aa  275  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
229 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 
232 aa  254  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1467  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
229 aa  244  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0237528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 
230 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
230 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
230 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
230 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  41.96 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
229 aa  208  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
230 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
238 aa  207  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
230 aa  207  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  41.96 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
237 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
229 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 
228 aa  205  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 
230 aa  204  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
237 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
237 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 
233 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  41.15 
 
 
231 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 
237 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 
247 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
237 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
237 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
237 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.36 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  42.04 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
233 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 
233 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  41.59 
 
 
233 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
233 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
234 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
230 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
234 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 
230 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
233 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
231 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
233 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 
234 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
234 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  43.48 
 
 
234 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 
234 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
236 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 
239 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 
239 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 
239 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  42.48 
 
 
229 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  43.48 
 
 
234 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 
230 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 
233 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
227 aa  191  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 
234 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 
223 aa  190  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 
234 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  40.87 
 
 
234 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 
234 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  41.3 
 
 
234 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
238 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 
234 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
233 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 
231 aa  188  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 
228 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
228 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 
237 aa  188  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
232 aa  187  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 
228 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 
231 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 
231 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
230 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 
235 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
232 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>