More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1374 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  68.53 
 
 
237 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  65.09 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 
277 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 
239 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 
239 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 
239 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  65.95 
 
 
248 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  65.52 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.52 
 
 
245 aa  308  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  65.37 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.22 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  64.66 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  64.58 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  64.66 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  64.68 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.5 
 
 
242 aa  300  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.5 
 
 
242 aa  300  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.66 
 
 
239 aa  292  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 
233 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  238  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
233 aa  217  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.18 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 
242 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 
237 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 
239 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 
239 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 
244 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.3 
 
 
237 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  42.54 
 
 
237 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 
237 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 
237 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
232 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
230 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
243 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 
253 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
237 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 
237 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 
237 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 
253 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 
237 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 
231 aa  201  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
239 aa  198  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
237 aa  198  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
237 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 
227 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 
231 aa  198  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 
232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
232 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 
223 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 
229 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
229 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 
233 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 
230 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 
233 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  43.16 
 
 
260 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 
229 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
233 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
229 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
243 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 
229 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  45.15 
 
 
250 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
232 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 
235 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 
254 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 
233 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 
235 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
228 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 
230 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04992  positive response regulator for pho regulon  41.92 
 
 
256 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
233 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
250 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
235 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  45.37 
 
 
256 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 
250 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 
234 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
229 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>