More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0470 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  73.93 
 
 		 241 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.15 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  72.73 
 
 		 239 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  72.73 
 
 		 239 aa  351  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  71.31 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  72.73 
 
 		 272 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.74 
 
 		 242 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  73.16 
 
 		 239 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  73.16 
 
 		 239 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  73.16 
 
 		 239 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.74 
 
 		 242 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  72.15 
 
 		 266 aa  348  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  72.73 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  72.53 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.62 
 
 		 245 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  67.65 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  59.66 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  53.45 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.72 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  43.4 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 321 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  47.37 
 
 		 230 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 242 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  41.2 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.29 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  44.93 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.98 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.63 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  39.39 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 257 aa  188  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  43.81 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.45 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>