More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3085 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  59.05 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.84 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.94 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  53.91 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  53.91 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  53.91 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  53.91 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  53.91 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 		 223 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 241 aa  247  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  50.22 
 
 		 241 aa  247  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  50.22 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 250 aa  241  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 250 aa  241  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 250 aa  241  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  52.38 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  52.38 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  52.38 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.54 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.31 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 230 aa  224  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  47.44 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  51.11 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.15 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 227 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  51.11 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 236 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 226 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 229 aa  214  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  48.92 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>