More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2490 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 251 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  47.7 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.28 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.28 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.73 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.87 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  41.81 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  41.81 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.43 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  38.89 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.13 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  41.38 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  38.26 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.69 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 250 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  41.3 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04992  positive response regulator for pho regulon  41.7 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>