More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5358 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  97.49 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  97.49 
 
 		 239 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  88.69 
 
 		 277 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  96.23 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  96.23 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  96.23 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.98 
 
 		 245 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  87.87 
 
 		 248 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  85.42 
 
 		 251 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  82.14 
 
 		 266 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  80.6 
 
 		 238 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  76.69 
 
 		 237 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.74 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  77.16 
 
 		 241 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.29 
 
 		 242 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.29 
 
 		 242 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.73 
 
 		 239 aa  350  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  65.52 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 232 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  46.06 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.12 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.02 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  43.82 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  43.82 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 237 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 234 aa  195  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 237 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  45.56 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.11 
 
 		 237 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  46.29 
 
 		 227 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 229 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 233 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 229 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 233 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  40 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 229 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 230 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>