More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1508 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  77.54 
 
 		 277 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  76.69 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  76.69 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  76.69 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  76.27 
 
 		 239 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  76.27 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  76.69 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  73.42 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  75.53 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  74.15 
 
 		 266 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  74.89 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.68 
 
 		 245 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.57 
 
 		 242 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.98 
 
 		 242 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.98 
 
 		 242 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  70.69 
 
 		 238 aa  357  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.67 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  68.53 
 
 		 238 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.85 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  44.4 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.1 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  43.53 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.24 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 260 aa  195  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  43.86 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.73 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  43.46 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  43.46 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.21 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 229 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  43.46 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.22 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>