More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3872 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  64.19 
 
 		 229 aa  324  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  64.19 
 
 		 229 aa  324  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  63.76 
 
 		 233 aa  324  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  63.76 
 
 		 233 aa  324  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  63.76 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  64.19 
 
 		 229 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  64.19 
 
 		 229 aa  322  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  63.76 
 
 		 229 aa  322  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.21 
 
 		 232 aa  298  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  59.39 
 
 		 230 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.95 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.07 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1467  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 229 aa  247  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0237528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  44.93 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  44.49 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.93 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  44.2 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  43.86 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  43.81 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  43.42 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  41.45 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 321 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  42.61 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  42.61 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  42.61 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  42.61 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  42.61 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  42.61 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  42.61 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  42.24 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  41.59 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  43.56 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  42.61 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>