More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0963 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  57.46 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  51.75 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 233 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  53.1 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  52.65 
 
 		 233 aa  255  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  53.1 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  53.1 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 233 aa  255  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  51.32 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  50 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  49.78 
 
 		 233 aa  241  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 232 aa  226  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  46.52 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  49.56 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  49.56 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  47.77 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  47.14 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  47.14 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  47.16 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  47.16 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0041  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>