More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1735 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  83.26 
 
 		 229 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  79.74 
 
 		 230 aa  384  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  80.09 
 
 		 230 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  57.21 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  57.21 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  56.77 
 
 		 231 aa  265  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  56.77 
 
 		 231 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  55.9 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  55.9 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  55.9 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  55.9 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  57.21 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  51.54 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  51.1 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  51.1 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  51.1 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  50 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  49.56 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  48.25 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 232 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  46.29 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  46.46 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.11 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  40.69 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  40.89 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>