More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2359 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  99.57 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  60.7 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.59 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.83 
 
 		 228 aa  278  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  60.09 
 
 		 234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  59.23 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  56.77 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  57.27 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  57.46 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  57.02 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  57.27 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  56.58 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  55.22 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.03 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  54.11 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  53.68 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  55.36 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  53.48 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  54.74 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  51.27 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  51.52 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  51.08 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 232 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 232 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 232 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.89 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  44 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  42.22 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.3 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>